肽谱图（PMF）、肽指纹图谱、蛋白结构分析、二硫键、糖基化、磷酸化
肽图谱可以：1）证实一种蛋白质一级结构（氨基酸序列）包括其 N和C端，2）提供蛋白质修饰基团的位点和所占比例，如糖基化，乙酰化，硫酸盐化和磷酸化等。
2D蛋白胶点鉴定
iTRAQ/TMT蛋白组定量分析 SILAC蛋白组定量分析 Label Free非标定量分析 半定量分析（spectral count） 鸟枪法蛋白全谱分析 2D蛋白胶点鉴定 单一蛋白高覆盖度分析
SWATH蛋白定量（蛋白质组）
SWATH（Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragmentions）定量技术
北京伯奥克生物技术有限公司SELDI技术服务
北京伯奥克生物技术有限公司拥有较为成熟的SELDI-TOF-MS技术，用于快速而有效地对蛋白样品进行分离、处理、数据分析和鉴定，建立蛋白质组数据库，发现疾病的相关蛋白和具有重要应用前景的生物标记分子.
蛋白质组 TMT标记
该技术采用2种、6种或10种同位素的标签，特异性标记多肽的氨基基团，经过串联质谱LC-MS/MS分析，可同时比较2组，6组或最多10组不同样品中蛋白质的相对含量。